对于陈济怀的说辞，琉球王尚泰与其臣属们，自是无有不从。
如今除了仰仗陈济怀之外，面对着国家一系列的问题，他们也找不出旁的方法来解决。
于是在接下来的几日里，琉球王便在陈济怀的指导下，对琉球国的内政外交开始了整顿。
在内政上，裁汰替换掉亲日派官僚后，琉球国原本被日本人或亲日派把持的各项政务，终于重归自主。
但如今琉球国已与列国缔约通商，也由此产生了许多，如海关事务等，新的政务。对于这些，琉球人并无经验，只能由陈济怀派人协助开展。
在防务上，琉球国原本的军队，兵力不足，装备落后，战力孱弱。
在日本人长期的限制下，更是除了执行典仪、护卫、巡捕之类的任务外，几乎无实战能力，形同虚设。
因此，尽管首里城和那霸的日军已被陆续剿灭干净，但清理琉球其他地方，收复被占的奄美诸岛，以及今后琉球的防务，就只得依靠商团的力量。
在外交方面，琉球国完全没有开展近代外交事务的经验，所以由陈济怀帮助其建立机构，逐步学习办理，也成为琉球唯一的选择。
至于陈济怀所说的三件要务，自然也需由其指导完成。
其中，发给列国的照会，和代行征伐的授权，相对好办一些。无非是明确主旨和行文模式后，由琉球的文臣自行撰写，审验合格也便成了。
最重要的《琉球驻防协定》，则基本上出自陈济怀之手了。
在最后定稿签订后，这个协定瞧上去，却更像是一份琉球国的单方声明。因为签署的双方，一方为琉球国，另一方却只有陈济怀的画押。
直到后来，在陈济方加盖了两江总督关防后，才算是让这份协定看起来更像那么回事儿些。
不过这些并不影响协定的效力，因为在其文中有述，此协定内容在签署后，即行生效，无问署者为何。
这也开创了，陈家兄弟在无大清朝廷的授权下，私自缔约的先例。
《琉球驻防协定》的要旨有五项。
其一，明确了琉球国永为中原天朝的属臣，并接受中原为其提供的庇护，其内外一切政务也要接受中原的指导。
其二，为保卫国土臣民，琉球国诚请护商民团来国驻防，并授予其，代为征伐的权限。
其三，商团来琉球驻防，所需兵额多少，是否增减，何时增减，皆自行决断，并由琉球国提物资供给养和兵饷。
其四，商团来琉球驻防，所需占用土地和设施，在知会当地官府后，由当地妥为安排。驻防地域内一切事务，由驻防商团自行管理。
其五，商团帮助琉球国编练新军。
再过了几日后，陈济怀统领的远征舰队，已经彻底控制了琉球本岛。
他一面帮着琉球君臣稳定局面。一面又四处派出军力，收控周边的其他岛屿。
同时他还派遣了“九华山”号巡航舰返回上海，向国内传递琉球这边的消息。
并且要求后方，向琉球加派人员和物资，协助琉球开展建设，也准备下一步进军奄美。
陈济方得知远征琉球大获成功，十分高兴。对于四弟的要求，他也是全力支持。
其实，在他这边，也正在筹备着一场军事行动。他要派军出征台湾。
台湾的局势，已大为好转，本无需商团再出军增援。
在陆上方面，日军侵入台湾的兵力，不过三千六百多人。
起初，日军讨伐生番的过程比较顺利，也没有付出多大的人员伤亡。
但在随后企图长期占领时，日本人难耐台湾的瘴气，出现了十分严重的非战斗减员。
因此，在到达台湾近两个月后，日军在台兵员已降至不足三千。
这还要算上，那些已经病倒，待死不活的人头。所以实际能够参加战斗的日军人数，比这个数字还要低很多。
反观大清这边，李鸿章派来增援的淮军精锐，已经入台，共计十三个营六千五百人。福建方面组织起来的战力，也达二万五千余人。
陆上的兵力对比，大清这边已占据了绝对优势。海上亦是如此。
前面已经说过，日本在台湾就那么几艘破船。船政水师这边，则有十余艘新舰，完全可以对其碾压。
而且，此时日本人还并不知道，陈济怀已然掌控了琉球。
这意味着，台湾的日军与日本本土的联系已经被切断，增援和补给都不会再有了。
即使日本也可以选择绕开琉球，但等他们得知了琉球那里发生的事情后，估计更多的该是想着如何集中力量守护自家沿海了。
海陆皆有如此巨大的优势，清军收拾起在台的日军，当会比陈济怀在琉球的行动更加容易。
然而……清军的各位高级将领们，想的却不是一鼓作气，消灭侵略者。
沈葆桢虽然答应过陈济方，不再主动与日本人交涉，但他在心中仍然寄希望于日军能够自行退走。
他毕竟是位文臣，主动决战的勇气不足。这也是千百年来，中原王朝文臣领兵的弊病。
沈葆桢也确有为难之处。李鸿章派来淮军，说得豪气十足，但在话里只提“协防台湾”。
淮军将领，为了保存实力，也不愿真就上阵拼杀。
至于福建之兵，虽然人数众多，但却是临时拼凑起来的。能有多大战力，沈钦差心中没底。
在海上，沈大人虽是大清海防的积极倡导者，但并不是海军专家。
他不懂得应该如何发扬舰队的作用，只把监视、转运，当成其主要任务。
因此当刘步蟾、林泰曾、邓世昌等年轻水师将领，屡次请求主动出战时，皆被上司驳回。徒令这群船政学堂毕业的青年才俊们，顿足叹息。
就这样，在各方面的实力都明显胜出的情况下，清军却自己放弃了主动。只是在外围，远远的监视、防范着日军。
这种毫无血性的做法，可是气坏了陈济方。
所以他要整顿商团兵马，赴台湾上阵杀敌。